A RFB (Receita Federal do Brasil) já começou a emitir as Intimações pertinentes a erros ou omissões no envio das GFIP's.
Em sua maioria a própria RFB permite que o contribuinte faça retificações, quando necessárias, para que seja ajustado as informações declaradas com os próprios recolhimentos.
Nos caso mais comuns, quando o contribuinte informou a GFIP sem movimento, porém, efetuou o pagamento da respectiva GPS, basta fazer uma retificadora na GFIP constando o valor que foi pago na GPS (se possível for), caso o pagamento seja proveniente de pagamento indevido basta utilizar o crédito para compensar no futuro.